يتميز مناخ نابلس باعتداله، ويعود السبب في ذلك لموقع المدينة ضمن إقليم البحر المتوسط، حيث تصل معدلات درجات الحرارة العظمى في فصل الشتاء وتحديدا في أكثر أشهر أشهر السنة برودة (كانون الثاني) إلى 13.1 درجة مئوية، في حين تهبط إلى 6,2 درجة مئوية.

أما في في فصل الصيف في شهر آب، يصل معدل درجات الحرارة العظمى إلى 29,4 درجة مئوية، في حين تهبط إلى 19,5 درجة مئوية. وتعد الرياح الشمالية الغربية هي الرياح السائدة في منطقة نابلس حيث يبلغ معدل سرعتها 10 كم/الساعة، أما معدل نسبة الرطوبة فيها فتصل إلى 61%.